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\documentclass[12pt]{book}
\usepackage{caption}
\usepackage{autonum}
\begin{document}
\makeatletter
\autonum@patchParametrizedFullEnvironment{figure}%
% \autonum@patchFullEnvironment{figure}%
\makeatother
\ref{eq1}, \ref{fig1}, \ref{eq2}, \ref{fig2}, \ref{sec:xyz}
\begin{figure}[ht]
\begin{align}\label{eq1}
x=y
\end{align}
\caption{Caption}
\label{fig1}
\end{figure}
\subsection{Title}
\label{sec:xyz}
\begin{figure}[ht]
\begin{align}\label{eq2}
y=z
\end{align}
\caption{Caption}
\label{fig2}
\end{figure}
\end{document}
% \documentclass{article}
% \usepackage{caption}
% \usepackage{autonum}
%
% \begin{document}
% \begin{figure}
% \begin{align}
% a
% \end{align}
% \end{figure}
% \begin{figure}
% b
% \label{fig2}
% \end{figure}
% \end{document}
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