デフォルトではサーチされた文字列は、赤で表示されます。gray scale表示では、赤の16階調で文字列が表示されますが、Windowsの画面が256色モード、あるいは、それ以下では、色が正確に表現できません。
画面をHigh color または Full color にする、色づけを箱の形などに変える(Property Sheets->[Search])、gray scaleを変更する、などの対処が考えられます。
また、color specials によって既に色付けされた文字は、見つかっても色が変わりません。この時は、アンダーラインや箱、あるいは、カーソル移動で示すようにするとよいでしょう。