Option->Install を既に行った後、再度 Option->Installでパラメータの初期設定や、スタートアップメニューへのdvioutの登録などを実行しても何ら差し支えありません。

異なる設定を行うと、以前の設定が書き換えられるだけです。Option->Uninstallの必要はありません。

dviout for Windowsの入っているディレクトリ(フォルダー)を変更した場合などは、Option->Installを再実行するとよいでしょう。